W południe na wspólnej modlitwie spotkali się przedstawiciele różnych Kościołów i związków wyznaniowych. Towarzyszyli im posłowie, samorządowcy, mieszkańcy miasta. Kościół katolicki reprezentował ks. kan. Bartłomiej Stark, proboszcz parafii pw. Chrystusa Króla. W modlitwie wspominał m.in. śp. Pawła Adamowicza, prezydenta Gdańska, inicjatora powstania cmentarza-pomnika. Następnie słowa modlitwy wypowiadali duchowni różnych Kościołów i wyznań, wspominając o historii miasta i związkach swoich wiernych z grodem nad Motławą.

Co roku 1 listopada na cmentarzu odbywa się spotkanie międzywyznaniowe, w którym biorą udział przedstawiciele różnych wyznań oraz mieszkańcy miasta. Zebrani modlą się razem, każdy według swego wyznania za dusze zmarłych gdańszczan. Uroczystość przypomina o bogactwie wielokulturowości miasta w minionych wiekach.

Symboliczna nekropolia upamiętnia 27 cmentarzy, które po 1945 r. zniknęły z mapy Gdańska. Została otwarta w maju 2002 r. podczas I Światowego Zjazdu Gdańszczan. Urządzono ją u podnóża Góry Gradowej, na terenie powstałego w drugiej połowie XIV w. cmentarza Bożego Ciała zamkniętego w 1956 r., w latach 60. zamienionego w park.

Na Cmentarzu Nieistniejących Cmentarzy jest 38 płyt nagrobnych pochodzących z XVIII, XIX i XX w., ocalałych i przeniesionych z różnych zlikwidowanych gdańskich nekropolii. W centralnym punkcie stoi pomnik z napisem: "Tym, co imion nie mają na grobie, a tylko Bóg wie, jak kto się zowie".