Miejscowość Łostowice wzmiankowana była już w 1227 r. w średniowiecznych przekazach dotyczących początków parafii św. Katarzyny w Gdańsku. Wydany w 1884 r. „Słownik geograficzny Królestwa Polskiego i innych krajów słowiańskich” wspomina, że gdy w 1577 r. Stefan Batory oblegał Gdańsk, rozbił obóz w dolinie łostowickiej. Miejscowość była też świadkiem zdobycia w 1813 r. miasta przez Prusaków, którzy stąd kierowali oblężeniem. Po I wojnie światowej teren obecnej parafii został włączony do Wolnego Miasta Gdańska.