Parafia pw. św. Karola Boromeusza w Wejherowie powstała 13 maja 2011 r. na mocy dekretu metropolity gdańskiego i obejmuje wschodnią część miasta w dzielnicy Śmiechowo oraz zachodnią stronę Redy-Pieleszewa. Pierwszym proboszczem został ustanowiony ks. Adam Pleskot. Teren pod budowę kościoła, wcześniej należący do parafii pw. Trójcy Świętej, na mocy aktu notarialnego przekazał ks. Tadeusz Reszka, ówczesny wejherowski dziekan.

Ksiądz Pleskot rozpoczął organizację nowej placówki duszpasterskiej. Od samego początku Msze św. niedzielne odbywały się w holu Zespołu Szkół nr 2 (dzisiejsza Szkoła Podstawowa nr 5 im. F. Chopina).

W uroczystość Podwyższenia Krzyża Świętego – 14  września 2011 r. – zostały poświęcone krzyż i plac kościelny. Od czasu do czasu ze szkolnych murów przenoszono się z modlitwą na teren parafialny, gdzie powstał tymczasowy ołtarz plenerowy.

budowlane przy domu parafialnym, w którym zaplanowano również kaplicę, rozpoczęły się 31 października 2012 roku. Pierwsza Msza św. w surowej kaplicy to była Pasterka w 2013 r., jednak dopiero od Rezurekcji w 2014 r. liturgia na co dzień została przeniesiona do nowego miejsca.

2 marca 2015 r. uroczyście zainaugurowano budowę kościoła przez symboliczne wbicie pierwszej łopaty. W uroczystości wzięli udział liczni wierni, a także władze samorządowe. – Od Szczecina aż po Elbląg będzie to najpiękniejsza świątynia – mówi abp Głódź.