Przełom i początek dla archidiecezji gdańskiej przyszedł pod koniec 1925 roku. 30 grudnia papież Pius XI ogłosił bullę Universa christifidelium cura, na której mocy administratura apostolska została podniesiona do rangi samodzielnej diecezji. Ten sam dokument wyznaczał Oliwę jako siedzibę biskupią, a Kościół Trójcy Świętej, związany z dawnym zespołem pocysterskim – jako katedrę nowo utworzonej diecezji. Kilka dni później, 3 stycznia 1926 r., osobnym pismem papież mianował Edwarda O'Rourkego pierwszym biskupem gdańskim. W praktyce oznaczało to domknięcie okresu prowizorium i początek budowania Kościoła lokalnego w realiach Wolnego Miasta Gdańska, z jego napięciami językowymi i narodowościowymi.